赤潮監(jiān)測的總目標(biāo)是為了及時(shí)準(zhǔn)確了解赤潮發(fā)展的現(xiàn)狀和趨勢，保護(hù)海洋生態(tài)系統(tǒng)，保障人體健康和生命安全，減輕和避免有害藻華對(duì)海水養(yǎng)殖、捕撈漁業(yè)、濱海旅游等海洋產(chǎn)業(yè)的損害，防止和減輕海洋赤潮災(zāi)害造成的損失，并為赤潮的預(yù)測、早期預(yù)警系統(tǒng)的建立提供服務(wù)。
赤潮監(jiān)測目標(biāo)一般分為兩大類：
海洋生物資源管理監(jiān)測：包括貝類資源;魚類資源和珍稀瀕危物種資源的管理監(jiān)測；
海洋環(huán)境質(zhì)量管理監(jiān)測：包括娛樂水體和底質(zhì)質(zhì)量管理、對(duì)自然生態(tài)系與公共健康的保護(hù)的管理監(jiān)測；

近年來連續(xù)發(fā)生的海洋赤潮，面積大、周期長，嚴(yán)重破壞了海洋生態(tài)系統(tǒng)，給旅游業(yè)、漁業(yè)和水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大損失。因此，對(duì)海洋赤潮發(fā)生區(qū)域及時(shí)進(jìn)行監(jiān)測，可以有助于政府和相關(guān)部門采取相應(yīng)措施，減少赤潮帶來的經(jīng)濟(jì)損失，對(duì)保護(hù)海洋生態(tài)環(huán)境也具有重要意義。

海洋赤潮監(jiān)測(預(yù)警)報(bào)告應(yīng)包括以下全部或部分內(nèi)容。依據(jù)監(jiān)測目的、內(nèi)容和具體要求,可對(duì)下列章節(jié)及內(nèi)容適當(dāng)增減。
1、 前言
2、 監(jiān)測方案
3、 監(jiān)測內(nèi)容與檢測分析
4、 分析與評(píng)價(jià)
5、 跟蹤監(jiān)測
6、 赤潮災(zāi)害（顯性）評(píng)估
7、 赤潮監(jiān)測結(jié)果的綜合分析與評(píng)價(jià)
8、 監(jiān)測監(jiān)視數(shù)據(jù)報(bào)表

赤潮是在特定的環(huán)境條件下，海水中的某些浮游植物、原生動(dòng)物或細(xì)菌性增殖或高度聚集，引起水體變色或?qū)Ｑ笾衅渌锂a(chǎn)生危害的一種生態(tài)異常現(xiàn)象。赤潮監(jiān)測工作以赤潮監(jiān)測技術(shù)規(guī)程HYT069-2005為監(jiān)測標(biāo)準(zhǔn)，進(jìn)行針對(duì)性監(jiān)測工作。

赤潮監(jiān)測項(xiàng)目和跟蹤監(jiān)測項(xiàng)目可按下表內(nèi)容適當(dāng)增減。有特殊目的的赤潮監(jiān)測內(nèi)容可根據(jù)具體要求在此基礎(chǔ)上增加監(jiān)測內(nèi)容。
觀測項(xiàng)目：赤潮位置與范圍、可視性采樣、色、味、嗅、漂浮物；
水文氣象要素：海表水溫、水色、透明度、鹽度、海況、海流流速、流向、日照、光衰減率、風(fēng)速、風(fēng)向、氣溫、氣壓、天氣現(xiàn)象、雨量、河流徑流量；
生物學(xué)要素：浮游植物(赤潮藻類)種類及數(shù)量、底棲微藻(赤潮藻類)種類及數(shù)量、其他赤潮生物(纖毛蟲類等)、底泥孢囊、浮游動(dòng)物種類及數(shù)量、底棲生物(養(yǎng)殖生物)種類及數(shù)量、葉綠素a、異養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)；
赤潮毒素：麻痹性貝毒(PSP)、腹瀉性貝毒(DSP)、神經(jīng)性貝毒(NSP)、失憶性貝毒(ASP)、西加魚毒素(CFP)；
水化學(xué)要素：pH鹽度、溶解氧、活性磷酸鹽、活性硅酸鹽、亞硝酸鹽-氮、硝酸鹽-氮、氨-氮、油類、鐵、錳、海水中維生素B1、海水中維生素B12；

HYT069-2005 赤潮監(jiān)測技術(shù)規(guī)程
GB 3097—1997 海水水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)
GB 12763.2 海洋調(diào)查規(guī)范海洋水文觀測
GB 12763.3 海洋調(diào)查規(guī)范海洋氣象觀測
GB 12763.6 海洋調(diào)查規(guī)范海洋生物調(diào)查
GB 17108 海洋功能區(qū)劃分技術(shù)導(dǎo)則
GB 17378.1 海洋監(jiān)測規(guī)范第1部分:總則
GB 17378.2 海洋監(jiān)測規(guī)范第2部分:數(shù)據(jù)處理與分析質(zhì)量控制
GB 17378.3 海洋監(jiān)測規(guī)范第3部分:樣品采集,貯存與運(yùn)輸
GB 17378.4 海洋監(jiān)測規(guī)范第4部分:海水分析
GB 17378.7 海洋監(jiān)測規(guī)范第7部分:近海污染生態(tài)調(diào)查和生物監(jiān)測
GB 18421—2001 海洋生物質(zhì)量