蝕斑檢測法是檢測活病毒(有感染力)數(shù)量的方法
- 病毒空斑實(shí)驗(yàn)是運(yùn)用*普遍的病毒滴度檢測方法之一。Renato Dulbecco在1952年首先采用這種方法來計(jì)算噬菌體的感染力,自那以后,這種方法被普遍用于各種病毒的定量 。 一個(gè)蝕斑通常是由*后感染培育的宿主細(xì)胞單層的一個(gè)病毒顆粒構(gòu)成的。 為此,在做空斑實(shí)驗(yàn)時(shí),需求將病毒液作10倍梯度延續(xù)稀釋,再區(qū)分感染相應(yīng)的敏感細(xì)胞單層,孵育一段時(shí)間后,在細(xì)胞單層上掩蓋一層半固體培育基(*常用的是瓊脂糖)以防病毒從一末尾的宿主細(xì)胞分散至左近未感染的細(xì)胞。這樣,每個(gè)病毒顆粒會(huì)在單層細(xì)胞上形成一個(gè)由未感染細(xì)胞圍繞的小圓斑即稱為空斑,當(dāng)空斑長到足夠大時(shí),可在顯微鏡下觀察甚至直接肉眼可見。 圖4為病毒空斑實(shí)驗(yàn)的基本流程。計(jì)數(shù)不同稀釋度下的空斑構(gòu)成數(shù)量可以知道每毫升病毒顆粒數(shù)或每毫升空斑構(gòu)成單位(PFU)。由于每個(gè)空斑來自于后來的1個(gè)病毒顆粒,這樣可以從單個(gè)空斑中純化失掉來源于單個(gè)克隆的病毒種群。但很多時(shí)分,為了更清楚地區(qū)分空斑,需求對(duì)細(xì)胞用MTT或中性紅等染料停止染色以添加細(xì)胞與空斑間的對(duì)比度。另外,細(xì)胞形狀關(guān)于空斑實(shí)驗(yàn)成功與否也至關(guān)重要,需求運(yùn)用途于對(duì)數(shù)生臨時(shí)且生機(jī)大于95%的安康的宿主細(xì)胞。病毒空斑實(shí)驗(yàn)比擬費(fèi)時(shí),依據(jù)病毒種類不同,通常需求4-10天時(shí)間。還有,空斑實(shí)驗(yàn)只適用于那些可以繁衍并能感染培育細(xì)胞單層的病毒,以及可以破壞細(xì)胞的病毒。
圖 1. 病毒空斑實(shí)驗(yàn)的流程。
- 資料與設(shè)備
- 細(xì)胞生長培育基:含10%FBS(胎牛血清), 4-6mM Glutamine(谷氨酰胺)的高葡萄糖DMEM,若有需求可參與青霉素,鏈霉素,慶大霉素,兩性霉素等
- 成斑培育基:含2%FBS(胎牛血清), 4-6 mM Glutamine(谷氨酰胺)的高葡萄糖DMEM
- 宿主細(xì)胞
- PBS磷酸緩沖液
- 瓊脂糖,超純
- 空斑染色資料(MTT或中性紅)
- 細(xì)胞培育級(jí)無菌超純水
- 移液槍頭(10 到100 微升)
- 6孔細(xì)胞培育板
- 離心管
- 水浴箱
- 微波爐
- 倒置顯微鏡
- 生物平安柜(超凈臺(tái))
- 二氧化碳培育箱
- 細(xì)胞接種:每孔按1 x 106細(xì)胞每毫升培育基接種細(xì)胞至6-孔板里。悄然地前后左右搖晃培育板使細(xì)胞散布平均。將細(xì)胞置培育箱生長過夜。第二天,顯微鏡下觀察細(xì)胞確認(rèn)細(xì)胞能否散布平均并到達(dá)80%以上的融合度。
- 制備瓊脂糖:用水配制2%的瓊脂糖,高壓滅菌并使之溶化,然后將瓊脂糖置于42°C水浴中使之堅(jiān)持在熔解形狀。將細(xì)胞培育基預(yù)熱至37°C。(1h后確認(rèn)瓊脂糖溫度能否處于42°C,觀察其能否仍處于溶解形狀但又不至于燙手)。
- 預(yù)備病毒梯度稀釋液:標(biāo)志6個(gè)無菌離心管,用于制備病毒稀釋液。在第1管內(nèi)參與990μl,剩下5管區(qū)分參與900μl細(xì)胞生長培育基。按以下方法停止梯度稀釋:在第1管中參與10μl病毒原液(稀釋度1:100)充沛混勻,然后從第1管吸100μl參與第2管,依次類推,停止10倍梯度稀釋。管2至管6的稀釋度區(qū)分為 10-3 到 10-7。
- 感染細(xì)胞單層:用無菌吸管吸去6孔板中的培育液,每孔參與100 μl上述稀釋好的10-3 到 10-7 的病毒液,留一個(gè)孔不加作為空白對(duì)照。每板按異樣的方法操作。室溫放置1h讓病毒進(jìn)入宿主細(xì)胞。
- 掩蓋瓊脂糖:1h后,小心吸去病毒液,防止碰到細(xì)胞。將2%的瓊脂糖和預(yù)熱的培育基按1:1的比例混勻后加悄然地加1.5mL至每孔細(xì)胞上,室溫靜置20min使其冷卻凝結(jié)成掩蓋層。將培育板置室溫或 27°C 培育 6-10 日。
- 空斑觀察和計(jì)數(shù):用光從45度角照射培育板,或許可以將培育板倒置在一個(gè)黑色背景上,計(jì)數(shù)空斑數(shù)量。為了更易于觀察,也可以每孔參與1mL 0.03%的中性紅(用水或PBS稀釋),室溫或27°C 孵育2-3h,未被病毒感染的細(xì)胞會(huì)被中性紅染上而中間未被著色的小區(qū)域即為空斑(直徑約為0.5-3mm)。計(jì)數(shù)每孔的空斑數(shù)量并按以下方法計(jì)算病毒滴度:病毒滴度(pfu/ml)=空斑數(shù)×(1 ml / 0.1 ml)/稀釋倍數(shù)
結(jié)果圖相似這種:
數(shù)量檢測法是死活病毒都一同檢測的方法,如今實(shí)驗(yàn)室普遍采用的是多聚酶鏈反響 (PCR)
PCR是用來檢測病毒核苷酸的運(yùn)用*廣的方法之一。PCR剖析也可以用于病毒RNA的鑒定,只需先將RNA逆轉(zhuǎn)錄成DNA,然后再停止PCR剖析,這一方法被稱之為逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)。實(shí)時(shí)PCR(或稱為定量PCR,qPCR)是在反響進(jìn)程中,實(shí)時(shí)對(duì)病毒核苷酸停止定量的方法。Real-time PCR有兩種:一種是基于探針的叫TaqMan PCR,另一種是基于染料摻入的叫SYBR Green法。圖2用表示圖顯示了Real-time PCR的基本原理。
圖 2 Real-time PCR實(shí)驗(yàn)原理圖。
文獻(xiàn)來源: 快速病毒鑒定和定量檢測方法綜述
下面是病毒檢測的基本方法, 水中的病毒典型的有諾如病毒,輪狀病毒,腸道病毒71型,戊型肝炎病毒等。 需求針對(duì)這些病毒檢查相應(yīng)的檢測方法,中文文獻(xiàn)可以查一下。
也有文獻(xiàn)引薦兩種方法結(jié)合的。
水中病毒的檢測還要觸及稀釋步驟, 也需查閱